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怎么通过一株菌的名字了解它的前世今生

红皇后学术 红皇后学术 2022-06-07


在做微生物研究的很多时候,我们都需要查找与目标微生物相关的各种信息,而在这项工作最开始的时候,我们通常只是有这个微生物的名字,下面介绍两个网站,可以方便的查找各种微生物目前已知的相关信息。


MicrobeWiki

MicrobeWiki是一个免费的微生物百科,其类似于维基百科,用户可以自行上传和编辑内容。

该网站分为Curated pages和Student pages,其中Curated pages的内容由Kenyon College的微生物学家进行审阅和更新,以保证内容的准确性

MicrobeWiki的内容按照微生物所属的界的不同,分为细菌、古菌、真核和病毒,用户可以通过微生物的名称进行查找。

每一个微生物对应的条目界面基本于维基百科结构一致,包含于该微生物有关的各个方向的已知内容。

MicrobeWiki的缺点是其没有覆盖所有微生物,所有一些研究很少的冷门微生物可能会查不到


NCBI Taxonomy

接下来介绍一个信息全面的,NCBI中包含一个Taxonomy数据库,其依托NCBI海量的数据,构建了根据物种分类学进行查找相关信息的数据库。

进入NCBI的主页之后,选择Taxonomy Browser即可进入该数据库,其按照生物的分类将信息分为6个大类。

点开之后是根据物种分类树构建的层次列表。

应用ctrl+F查找目的微生物的名称,即可看到NCBI中包含的所有属于该微生物的序列信息。

NCBI的优点是覆盖全面,只要是已经测定并公布的序列信息,都能够查到,但是缺点是只有序列信息和简单描述,查找所需序列十分方便,但用来写文章就需要自己进行归纳总结。

网站的地址微信发不了,自行搜索吧~


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